只有当子代性染色体异常并造成严重后果时，才允许性别选择。具体来说，性别选择只有在女孩（或男孩）会得某些疾病时才会被允许。
最常见的是性连锁疾病：
一、X性连锁隐性遗传病，如假肥大性肌营养不良（DMD）、色盲症、睾丸女性化病、鱼鳞苔藓病、眼白化病I型、Hunter综合征、无丙种球蛋白血症I型、糖鞘脂储积症、G-6-PD缺乏症、肾性尿崩症、血友病B、无汗性外胚层发育不良等。
三、Y连锁遗传病，如遗传性无精子症：Y染色体AZFA、AZFB或AZFC缺失。
对于家庭中有相关遗传疾病或生育史的夫妇，他们可以在生育之前可以先到遗传科进行遗传咨询，必要时可以通过第三代试管婴儿技术以帮助怀孕。不仅如此，对于家庭中有其他遗传疾病或生育史的夫妇，他们还可以通过第三代试管婴儿技术进行遗传咨询，以避免一些遗传疾病。
目前三代试管婴技术儿已经普及，不过每一代试管婴儿技术的花费都是不同的：第一代试管婴儿费用大概在3-5万左右，二代试管技术因为要用到单精子注射技术，所以费用也会相对较高，大概会花费4-6万左右。
而第三代试管婴儿因为加入了PGS/PGD胚胎染色体筛查技术，所以在费用方面也会比前两代试管高出不少，总体费用大概在8-10万元左右。
