许多接受试管婴儿的不孕不育夫妇私下里都希望有一个男婴，但事实上，即使做了试管婴儿，自然怀孕所生婴儿的性别比例基本上是一样的。我国法律明确禁止非医学需要的胎儿性别选择。男孩和女孩都是他们父母的宝贝，人们不必过于担心他们的婴儿的性别。
虽然男性和女性自然怀孕的比例基本相同，男性与女性的比例约为1.7:1，但如果考虑到一些意外流产等因素，最终生孩子的男性与女性的比例为1.05:1。事实上，大数据研究发现，许多生理和环境因素可以影响胎儿的性别。父母双方的年龄越大，越有可能生女儿。
2001年至2015年间，5832名中国母亲研究了7410名通过试管婴儿出生的婴儿，他们是单胞胎和双胞胎，分别有3902名男孩和3508名女孩。结果显示，单胎男孩明显多于双胎（53.97% vs 50.9%,p0.001），特别是在冷冻胚胎移植中。冷冻胚胎移植组的男婴数量高于新鲜胚胎移植组，而经排卵期胚胎移植的男婴数量更高，单胎和双胎分娩的男婴数量都更多（P0.001）。
因此，在第一代和第二代试管婴儿中，男孩在胚胎阶段发育较快，比女孩更容易形成胚胎囊。生女孩的概率随着父亲年龄的增长而明显增加（P=0.014），而且与国际上相比，父亲的身体质量指数（BMI）更高，生的孩子也更多。
比第二代试管婴儿出生的双胞胎多（P=0.046）。有更多的第二代试管婴儿双胞胎。大多数第二代试管婴儿是由于男性伴侣不孕，需要注射一个精子。此外，带有X（女性）染色体的精子更有可能看起来正常，而且更容易检查。此外，用Y精子受精的男性胚胎更有可能流产、早产，在怀孕的早期阶段更不可能存活，所以在自然怀孕中男性和女性的情况也是如此。
我可以选择一个男人和一个女人做试管婴儿吗？ ..;
第三代试管婴儿在技术上和理论上允许选择婴儿的性别。然而，我国法律明确禁止非医学需要的胎儿性别选择。因此，除非是由于某种与性别有关的疾病，特别是遗传性疾病，否则第三代试管婴儿可以用于性染色体筛查，选择婴儿的性别，以避免生出病儿，实现优生优育。
